第一、鉴定专家的确定
司法鉴定机构受理鉴定委托后，应当指定本机构中具有该鉴定事项执业资格的司法鉴定人进行鉴定。
委托人有特殊要求的，经双方协商一致，也可以从本机构中选择符合条件的司法鉴定人进行鉴定。与医疗事故鉴定不同的是，司法鉴定的机构本身就是有专家库的，鉴定的专家就是从本身的专家库中根据专业的要求抽取的。不同于医疗事故鉴定一个非常大的专家库，通过随机抽取的方式，确定专家的名单。
司法鉴定机构对同一鉴定事项，应当指定或者选择二名司法鉴定人共同进行鉴定;对疑难、复杂或者特殊的鉴定事项，可以指定或者选择多名司法鉴定人进行鉴定。与医疗事故鉴定的单数表决制不同，每一位鉴定专家的鉴定意见都应当在鉴定意见书中体现出来。并且在鉴定结论中有每一个专家的签名或者盖章。医疗事故的集体负责制，司法鉴定的个人负责制。
第二、鉴定专家的回避
1、司法鉴定人本人或者其近亲属与委托人、委托的鉴定事项或者鉴定事项涉及的案件有利害关系，可能影响其独立、客观、公正进行鉴定的，应当回避。
司法鉴定人自行提出回避的，由其所属的司法鉴定机构决定;委托人要求司法鉴定人回避的，应当向该鉴定人所属的司法鉴定机构提出，由司法鉴定机构决定是否回避。如果委托人对司法鉴定机构，是否实行回避的决定有异议的，可以撤销鉴定委托。
2、司法鉴定人应当回避的原因
如果委托的案件是进行重新鉴定，有下列情形之一的，司法鉴定人应当回避：
(一)参加过同一鉴定事项的初次鉴定的;
(二)在同一鉴定事项的初次鉴定过程中作为专家提供过咨询意见的。
这在法律上，是为了避免，鉴定专家在参见以前案件的鉴定过程中，避免主观上造成“先入为主”的情况。使鉴定结论客观、公正。
3、司法鉴定机构的自我监督
在鉴定机构就委托的鉴定事项完成后，司法鉴定机构可以指定专人对该项鉴定的实施是否符合规定的程序、是否采用符合规定的技术标准和技术规范等情况进行复核，发现有违反本通则规定情形的，司法鉴定机构应当予以纠正。